فشلت مديرية الأوقاف بالمنيا، اليوم، فى السيطرة على مساجد تنظيم الإخوان الإرهابية، عقب قيام عناصر الإخوان بطرد أئمة مساجد عمر بن الخطاب والرحمن بمنطقة أبو هلال، حيث تفرض العناصر الإخوانية سيطرتها على المسجدين كمنابر إخوانية بمدينة المنيا. بينما تستولى الدعوة السلفية على مسجدى أحمد بن حنبل والتوحيد.
كما قامت عناصر الإخوان بإغلاق أبواب مسجد “الرحمن الرحيم” بقرية “المطاهرة الغربية” بمركز أبو قرقاص.
وفشلت أوقاف المنيا فى بسط سيطرتها على 4 مساجد أخرى وإخضاعها لإدارة الأوقاف، وهى فاطمة الزهراء بحى شاهين، وعبدالجواد سالم بمركز سمالوط، ومسجدى الحق وعباد الرحمن بقرية دلجا بديرمواس.
كما قام السلفيون بالاستيلاء على قطعة أرض من أملاك الدولة فى مدخل المدينة الجامعية، ووضع أساس مسجد عليها، رغم صدور حكم قضائى لصالح جامعة المنيا بوقف البناء والإزالة، إلا أنه لم ينفذ حتى الآن، وأصبح مسجد المدينة الجامعية فى قبضة السلفيين.